次氯酸鈉具有很好的消毒滅菌作用，現在被自來水，游泳池，醫院，污水等地廣泛的用做各種水體方面的消毒使用。次氯酸鈉還能損壞氰根離子與苯環，所以也可以用在處理工業污染廢水的高級氧化方面，還能夠用于紙漿漂白，棉紡織品的漂白等等，濃度非常高的次氯酸鈉液體也能夠用于除去設備或者管道上面附著的沾泥。次氯酸鈉之所以具有滅菌的作用是因為它主要經過水解之后形成了次氯酸，然后再進行進一步分解之后形成新的氧，這種氧能夠使菌體與病毒經過強氧化性，將其中的蛋白質變性，就能夠使病源微生物致死，次氯酸鈉因其見效快價格低無危害被廣泛應用。